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小程序开发公司 科学家诞生的新式东说念主工智能,创造出“自然界中不存在”的卵白质

发布日期:2024-08-27 13:35    点击次数:58

ESM3模子不错从零启动“编写”新的卵白质,为合成生物学开采了新的可能性。

就像ChatGPT通过揣度序列中最有可能出现的单词来生成文本相通,一种新的东说念主工智能(AI)模子不错编写新的卵白质,这些卵白质不是重新启动自然产生的。

他们在7月2日发表在bioRxiv预印本数据库上的一项斟酌中说,科学家们使用新的模子ESM3创建了一种新的荧光卵白,其序列与自然产生的荧光卵白只消58%的相易。由前Meta斟酌东说念主员组成的公司Evoluaryscale的代表也在6月25日的一份声明中空洞了细节。

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斟酌小组在非买卖许可下发布了该模子的小版块,并将使该模子的大版块可供买卖斟酌东说念主员使用。凭证Evoluaryscale的说法,这项时候不错在从药物发现到蓄意塑料降解新化学品等各个领域发达作用。

ESM3是一个大型话语模子(LLM),雷同于OpenAI的GPT-4,后者为ChatGPT聊天机器东说念主提供能源,科学家们用27.8亿种卵白质测验了他们最大的版块。关于每种卵白质,他们索要了相关序列(组成卵白质的氨基酸构建块的规章)、结构(卵白质的三维折叠样式)和功能(卵白质的功能)的信息。他们随即屏蔽了这些卵白质的信息片断,并条件ESM3揣度缺失的片断。

他们将这个模子扩大了界限,这是归并团队还在Meta时所作念的斟酌。2022年,他们晓谕了EMSFold —— ESM3的前体,不错揣度未知的微生物卵白质结构。那一年,Alphabet的DeepMind还揣度了2亿个卵白质的卵白质结构。

科学家随后指出,这些东说念主工智能模子的揣度存在局限性,小程序开发资讯卵白质的揣度需要获取考据。然则,这些标准仍然不错大大加速对卵白质结构的搜索,因为另一种标准是使用X射线一一绘图卵白质结构,这种标准既慢又不菲。

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关联词,ESM3不单是是揣度现存的卵白质。期骗从7710亿个私有的结构、功能和序列信息中汇集的信息,该模子不错生成具有特定功能的新卵白质。Evoluaryscale的一位撑合手者将其描写为“生物学的ChatGPT时分”。

在这项新斟酌中,斟酌东说念主员对该模子进行了质疑,以产生一种新的荧光卵白 —— 一种拿获光并以更长的波长开释光的卵白质,使其发出新的绿色。这些卵白质对生物学斟酌东说念主员很紧迫,他们将它们附加到他们感意思意思的分子上,以追踪和成像它们。

该模子生成了96种具有可能产生荧光的序列和结构的卵白质。然后,斟酌东说念主员聘请了与自然荧光卵白相易序列最少的一种。自然,这种卵白质的亮度比自然绿色荧光卵白低50倍小程序开发公司,但ESM3产生了另一次迭代,产生了加多亮度的新序列 —— 后果是一种不同于自然界中发现的绿色荧光卵白,被称为“esmGPF”。Evoluaryscale团队推测,东说念主工智能在霎时完成的这些迭代,在自然界中需要5亿年的进化才智完竣。 



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